Roche uPath IVD Instrukcja obsługi

Marka: Roche

Model: uPath IVD

Typ: Instrukcja obsługi

Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy

obrazów tkanki gruczołu sutkowego —

Podręcznik

Spis treści

Wstęp 1

Podsumowanie i objaśnienie działania algorytmu 2

Przeznaczenie 3

Przeznaczenie produktu 3

Przeznaczenie podręcznika do algorytmu 3

Znaczenie kliniczne 4

Zasady testu 5

Ograniczenia metody 6

Charakterystyka sieci 7

Bezpieczeństwo danych 8

Przebieg pracy na potrzeby korzystania z algorytmu uPath HER2 (4B5) 9

Przebieg pracy wykonywanej przez patomorfologa 11

Charakterystyka barwienia 18

Ocena wybarwienia przy użyciu przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5) 18

Ocena wybarwienia za pomocą algorytmu uPath HER2 (4B5) 18

Charakterystyka wyników 30

Porównanie metod 30

Badania odtwarzalności wyników uzyskiwanych przez patomorfologów 31

Badania odtwarzalności wyników uzyskiwanych przy użyciu skanera 32

Rozwiązywanie problemów 33

Bibliograﬁa 37

Wstęp

Oprogramowanie Roche uPath enterprise software

(oprogramowanie uPath enterprise software) wyposażone

w algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu

sutkowego (algorytm uPath HER2 (4B5)) to oprogramowanie,

które zaprojektowano w celu wspomagania półilościowej oceny

ekspresji receptora ludzkiego naskórkowego czynnika wzrostu

typu 2 (HER2) w histologicznych skrawkach barwionych metodą

immunohistochemiczną (IHC) uzyskanych z prawidłowych i

nowotworowych tkanek utrwalonych w formalinie i zatopionych

w paraﬁnie (FFPE).

Oprogramowanie uPath enterprise software jest kompleksowym

cyfrowym narzędziem programowym do zastosowania

w patologii, które umożliwia laboratoriom patologicznym

rejestrowanie, przeglądanie, analizowanie i przekazywanie

cyfrowych obrazów próbek patologicznych, zarządzanie

nimi i tworzenie raportów na ich podstawie. Za pomocą

oprogramowania uPath enterprise software patomorfolog może

przeglądać obrazy cyfrowe w różnych powiększeniach, dodawać

adnotacje, dokonywać pomiarów na skrawkach tkankowych,

przeprowadzać analizę obrazową i generować raporty.

Uwaga: Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów

tkanki gruczołu sutkowego to uzupełniająca, wspomagana

komputerowo metoda przeznaczona do ułatwiania procesu

rejestracji obrazów z podstawowych szkiełek mikroskopowych,

na których znajdują się próbki tkanek gruczołu sutkowego

wybarwione immunohistochemicznie, oraz wykonywania

pomiarów na tych obrazach w celu określenia, czy w badanych

tkankach obecne jest białko HER2. Patomorfolog jest

odpowiedzialny za ewaluację zgodności wyników i zastosowanie

odpowiednich kontroli zgodnie z opisem w arkuszu metody

dla przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5) (dostępny

pod adresem dialog.roche.com), aby zagwarantować ważność

wyników analiz obrazowych.

1 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Podsumowanie i objaśnienie działania algorytmu

W przypadku zastosowań do analizy obrazowej patomorfolog

może używać oprogramowania uPath enterprise software

do wybierania i obrysowywania jednego lub kilku obszarów

zainteresowania (ROI), przy czym każdy obszar ROI może

być wyświetlany w różnych powiększeniach, a następnie

analizowany przez algorytm uPath HER2 (4B5). Generowana jest

łączna liczba docelowych komórek nowotworowych, a następnie

komórki nowotworowe są przydzielane do grupy komórek

wybarwionych lub niewybarwionych. Komórki wybarwione

są dzielone na podstawie intensywności wybarwienia oraz

kompletności wybarwienia błony. Algorytm uPath HER2

(4B5) łączy dane dotyczące odsetka wybarwionych komórek

(wybarwione, niewybarwione), intensywności wybarwienia

(słabe, umiarkowane, silne) i kompletności wybarwienia

błony (niewybarwiona, częściowe wybarwienie, całkowite

wybarwienie) w celu wygenerowania wyniku HER2 w skali od 0

do 3+. Algorytm uPath HER2 (4B5) może wygenerować wynik dla

określonego obszaru ROI lub sumaryczny wynik dla wszystkich

obszarów ROI zaznaczonych na danym preparacie. Patomorfolog

może zaakceptować wynik podany przez algorytm uPath

HER2 (4B5) lub zastąpić ten wynik innym wynikiem. Algorytm

uPath HER2 (4B5) nie dokonuje niezależnej interpretacji

danych; z tego względu powinien być używany wyłącznie przez

wykwaliﬁkowanych patomorfologów, w połączeniu z wynikami

badania histologicznego, stosownymi informacjami klinicznymi

oraz odpowiednimi kontrolami. Algorytm uPath HER2 (4B5)

został zaprojektowany jako pomoc dla patomorfologów w ocenie

ekspresji białka HER2 w próbkach tkanek gruczołu sutkowego

wybarwionych przy użyciu przeciwciała VENTANA anti-HER2/

neu (4B5) i jest przeznaczony do tego celu.

2 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Przeznaczenie produktu

Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu

sutkowego jest przeznaczony do wspomagania patomorfologów

w półilościowym wykrywaniu białka HER2 w utrwalonych

wformalinie i zatopionych w paraﬁnie skrawkach zmienionej

nowotworowo tkanki gruczołu sutkowego. W przypadku

stosowania algorytmu wraz z przeciwciałem VENTANA

anti-HER2/neu (4B5) Rabbit Monoclonal Primary Antibody

(przeciwciało VENTANA anti-HER2/neu (4B5)) algorytm służy

do pomocy w ocenie stanu pacjentów z rakiem sutka, dla których

rozważa się zastosowanie leczenia preparatem Herceptin

(trastuzumab), KADCYLA

(ado-trastuzumab emtanzyna) lub

PERJETA

(pertuzumab).

Uwaga: Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki

gruczołu sutkowego to uzupełniająca, wspomagana komputerowo

metoda przeznaczona do ułatwiania procesu rejestracji

obrazów z podstawowych szkiełek mikroskopowych, na których

znajdują się próbki tkanek gruczołu sutkowego wybarwione

immunohistochemicznie, oraz wykonywania pomiarów na tych

obrazach w celu określenia, czy w badanych tkankach obecne

jest białko HER2. Patomorfolog jest odpowiedzialny za ewaluację

zgodności wyników i zastosowanie odpowiednich kontroli zgodnie

z opisem w arkuszu metody dla przeciwciała VENTANA anti-

HER2/neu (4B5), aby zagwarantować ważność wyników analiz

obrazowych.

Ten algorytm jest przeznaczony do stosowania w diagnostyce in

vitro (IVD).

Przeznaczenie

Przeznaczenie podręcznika do algorytmu

Ten podręcznik do algorytmu uPath HER2 (4B5) (podręcznik do

algorytmu) opracowano w celu:

• udostępnienia ogólnych informacji dotyczących przeznaczenia

algorytmu uPath HER2 (4B5) oraz zasad i ograniczeń metody;

• zdeﬁniowania wymaganych materiałów, a także wymogów

wzakresie technologii informacyjnej, bezpieczeństwa danych

oraz sieci;

• przedstawienia kroków obsługi algorytmu uPath HER2 (4B5);

• udostępnienia obrazów fotograﬁcznych ilustrujących sposób

korzystania z algorytmu uPath HER2 (4B5);

• udostępnienia narzędzia ułatwiającego korzystanie z algorytmu

uPath HER2 (4B5) na skrawkach FFPE tkanki gruczołu

sutkowego barwionych przy użyciu przeciwciała VENTANA

anti-HER2/neu (4B5);

• udostępnienia przykładowych obrazów trudnych przypadków

w celu przedstawienia wskazówek dotyczących korzystania

zalgorytmu uPath HER2 (4B5) do oceny takich przypadków;

• przedstawienia charakterystyki wyników uzyskiwanych przy

użyciu algorytmu uPath HER2 (4B5).

3 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Znaczenie kliniczne

Rak sutka jest najczęstszym rakiem występującym u kobiet

i drugą główną przyczyną zgonów związanych z rakiem.

1,2

Szacowane jest, że jedna na osiem kobiet w Ameryce Północnej

zachoruje w jakimś okresie swojego życia na raka sutka.

Wczesne wykrycie choroby i wdrożenie odpowiedniego

leczenia mogą radykalnie poprawić ogólną przeżywalność.

3,4

Małe próbki tkanek można łatwo wybarwić rutynową metodą

immunohistochemiczną (IHC), co sprawia, że technika ta,

wpołączeniu z przeciwciałami rozpoznającymi antygeny istotne

dla interpretacji wybarwienia tkanek raka, stanowi skuteczne

narzędzie używane przez patomorfologów do ustalania

rozpoznania i określania rokowania choroby. Obecnie jednym

z ważnych markerów raka sutka jest onkoproteina HER2.

5,6,7,8

Wykazano, że stosowanie preparatów leczniczych, takich

jak Herceptin (trastuzumab), KADCYLA (ado-trastuzumab

emtanzyna) i PERJETA (pertuzumab), korzystnie wpływa

na stan niektórych pacjentów z rakiem sutka, zatrzymując

wzrost guza, a w niektórych przypadkach przyczyniając się

do zmniejszenia jego masy.

5,6,7,8,9

Leki te to humanizowane

przeciwciała monoklonalne, które przyłączają się do białka HER2

eksponowanego na komórkach rakowych.

5,8,9,10

Wykonanie diagnostycznego testu in vitro w celu oceny statusu

HER2 u pacjentów z rakiem sutka ułatwia lekarzom podjęcie

decyzji o zastosowaniu leków celowanych działających na

receptor HER2.

5,6,7,8

Przeciwciało VENTANA anti-HER2/neu

(4B5) jest przeznaczone do wykrywania ekspresji białka HER2

wraku sutka metodą IHC. Algorytm uPath HER2 (4B5) to

narzędzie używane w połączeniu z przeciwciałem VENTANA

anti-HER2/neu (4B5) ułatwiające ocenę stanu pacjentów

zrakiem sutka, dla których rozważa się zastosowanie leczenia

preparatem Herceptin (trastuzumab), KADCYLA (ado-

trastuzumab emtanzyna) lub PERJETA (pertuzumab).

4 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Zasady testu

Kryteria dotyczące intensywności i wzoru wybarwienia

błony komórkowej stosowane przez algorytm uPath HER2

(4B5) do obliczania wyniku:

Wzór barwienia Wynik Ocena barwienia

HER2

Nie obserwuje się barwienia

błonowego

0 Wynik ujemny

Słabe, częściowe barwienie

błony w dowolnej ilości komórek

rakowych

1+ Wynik ujemny

Całkowite barwienie błony

o nasileniu od słabego do

umiarkowanego w ponad 10%

komórek rakowych

2+ Wynik

niejednoznaczny*

Intensywne, całkowite

barwienie błony w ponad 10%

komórek rakowych

3+ Wynik dodatni

*Zalecane dokonanie oceny metodą ISH

Oprogramowanie uPath enterprise software wyposażone

walgorytm uPath HER2 (4B5) wykorzystuje techniki analizy

obrazowej w celu uzyskania wyniku HER2.

Algorytm uPath HER2 (4B5) używa wstępnie zdeﬁniowanych

parametrów w celu oceny obrazów tkanek wybarwionych przy

użyciu przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5).

Etapy analizy obrazowej:

• Wykrycie komórek na całym obrazie.

• Zaklasyﬁkowanie komórek do grupy komórek nowotworowych

lub komórek innego typu.

• Identyﬁkacja wybarwionej błony oraz przydzielenie błony

do następujących kategorii: częściowe lub całkowite

wybarwienie oraz wybarwienie o słabej, umiarkowanej lub silnej

intensywności.

• Obliczenie wyniku HER2 poprzez połączenie danych

dotyczących klasyﬁkacji komórek, intensywności wybarwienia

oraz klasyﬁkacji błony.

Sposób identyﬁkacji komórek nowotworu złośliwego oraz

obliczenia wyniku przez algorytm do analizy obrazowej

białka HER2:

• Algorytm uPath HER2 (4B5) identyﬁkuje komórki nowotworowe

na podstawie koloru, intensywności wybarwienia, rozmiaru oraz

cech morfologicznych.

• Zidentyﬁkowane komórki nowotworowe są klasyﬁkowane

jako komórki wybarwione na podstawie wykrytej błony oraz

wstępnie ustawionych wartości progowych.

• Do obliczenia wyniku HER2 algorytm uPath HER2 (4B5)

wykorzystuje zidentyﬁkowane wybarwione komórki i dzieli je na

podstawie intensywności i kompletności wybarwienia.

5 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Algorytm uPath HER2 (4B5) jest zaprojektowany do użytku

zprzeciwciałem VENTANA anti-HER2/neu (4B5). Jakość

wyników testu zależy całkowicie od jakości i dokładności

zobrazowanego preparatu IHC oraz uzyskanego obrazu, który

zostaje poddany analizie.

Zanim obrazy preparatów zostaną przekazane do

oprogramowania uPath enterprise software w celu ich analizy,

patomorfolog musi zweryﬁkować serię barwienia wykonywaną

przy użyciu przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5),

przeprowadzając ręczne badanie mikroskopowe preparatów

kontrolnych HER2, aby ustalić, czy uzyskano oczekiwane wyniki.

Należy przestrzegać zaleceń producenta przeciwciała VENTANA

anti-HER2/neu (4B5), w tym używać wszystkich dodatnich

i ujemnych materiałów do kontroli jakości w każdym cyklu

barwienia. Jeśli preparaty kontrolne nie nadają się do przyjęcia

na podstawie ręcznego badania mikroskopowego, próbki tkanek

należy ponownie poddać barwieniu, aby uzyskać akceptowalne

wyniki.

Patomorfolog musi przestrzegać zaleceń dotyczących

interpretacji wyniku barwienia przeciwciałem VENTANA anti-

HER2/neu (4B5).

Algorytm uPath HER2 (4B5) jest przeznaczony do użytku przez

wykwaliﬁkowanych patomorfologów w połączeniu z wynikami

badania histologicznego, stosownymi informacjami klinicznymi

oraz odpowiednimi kontrolami. Nie należy z niego korzystać

jak z autonomicznego narzędzia. Proces analizy wykonywanej

za pomocą tego algorytmu musi być nadzorowany przez

kompetentną osobę.

Algorytm uPath HER2 (4B5) może generować nieprawidłowe

wyniki, jeśli na zarejestrowanych obrazach widoczne jest

nietypowe wybarwienie (wybarwienie jąder, pigmentacja itd.).

Algorytm uPath HER2 (4B5) może odrzucić wydłużone jądra

komórek nowotworowych bez względu na ogólny kształt

komórki. Z tego względu zmiany nowotworowe zawierające dużą

liczbę komórek nowotworowych z wydłużonymi jądrami mogą

wymagać oceny ręcznej.

Algorytm uPath HER2 (4B5) przeszkolono, opracowano i

zwalidowano na następujących typach komórek: inwazyjny rak

zrazikowy, rak przewodowy, rak śluzowy, rak rdzeniasty, rak

brodawkowaty i rak drobnobrodawkowaty, a także na wielu

zmianach przerzutowych.

Nie przetestowano działania algorytmu uPath HER2 (4B5)

wprzypadku używania go z komputerem osobistym (PC) z domu

ani nie zwalidowano jego bezpieczeństwa i skuteczności w takiej

sytuacji.

Algorytm uPath HER2 (4B5) identyﬁkuje błony barwione DAB

o dowolnej intensywności i kompletności wybarwienia. Aby

algorytm mógł wygenerować wynik 1+ dla danego przypadku,

odsetek wybarwionych komórek nowotworowych musi

przekroczyć próg szumu równy 0,5%. Działanie takie nie jest

zgodne z wytycznymi przedstawionymi w arkuszu metody,

zktórych wynika, że wynik 1+ powinien być generowany już

po wykryciu jednej wybarwionej komórki. Z tego względu dla

przypadków z bardzo małą liczbą komórek z wybarwionymi

błonami może zostać wygenerowany wynik 0, a nie wynik 1+.

Próg szumu został wprowadzony, aby zagwarantować zgłaszanie

wyniku 0 dla prawdziwie negatywnych przypadków.

W celu zagwarantowania wykrycia nawet bladego wybarwienia

błony algorytm uPath HER2 (4B5) zaprojektowano w taki sposób,

aby był czuły względem koloru brązowego (barwienie DAB).

Ztego powodu algorytm może generować nieprawidłowy

wynik dla próbek tkanek zawierających brązowe artefakty, takie

jak pigmentacja, wybarwienie tła we włóknach mięśniowych

lub inne artefakty, które są wybarwione na brązowo.

Woprogramowaniu uPath enterprise software są dostępne

narzędzia, za pomocą których patomorfolog może wykluczyć

takie obszary. Są one omówione bardziej szczegółowo w części

dotyczącej charakterystyki barwienia.

Algorytm uPath HER2 (4B5) zaprojektowano w taki sposób, aby

był czuły względem przypadków o wyniku 2+. Z tego względu,

algorytm uPath HER2 (4B5) może błędnie oceniać niektóre

przypadki o wyniku 1+ jako przypadki o wyniku 2+. Przypadki

o wyniku 1+ mogą zostać błędnie ocenione jako przypadki

o wyniku 2+, szczególnie jeśli w nieco poniżej 10% komórek

nowotworowych będzie obserwowane barwienie całkowite

lub w dużym odsetku komórek nowotworowych będzie obecny

odczyn cytoplazmatyczny. W takich przypadkach może wystąpić

konieczność zastąpienia wyniku przez patomorfologa. Odczyn

cytoplazmatyczny został omówiony bardziej szczegółowo

wczęści dotyczącej charakterystyki barwienia.

Ograniczenia metody

6 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

7 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Charakterystyka sieci

Zalecana prędkość połączenia sieciowego między oprogramowaniem uPath enterprise software a systemem zarządzania obrazami

(IMS) to 1 Gb/s.

Tabela 1. Specyﬁkacja serwera Roche uPath do analizy obrazów dla małych laboratoriów.

Parametr Szczegóły

Procesor CPU 3,6 GHz

Liczba rdzeni 4

Pamięć RAM 6 x 8 GB (48 GB)

Funkcja hyper-threading Wyłączona

Dysk twardy Dysk SSD o poj. 240 GB

System operacyjny Microsoft Windows Server 2016

Obsługa maszyny wirtualnej (VM) Tak

Dodatkowe informacje o maszynie wirtualnej Wydajność będzie inna niż w przypadku serwerów ﬁzycznych z powodu narzutu

związanego z maszyną wirtualną.

Program antywirusowy Symantec Endpoint Protection, wersja 12

Zasilanie 110 V/220 V, 800 watów (2)

Porty 2 USB, adapter HPE Eth 10/25 Gb

Zasilanie bezprzerwowe Zalecane

Tabela 2. Specyﬁkacja serwera Roche uPath do analizy obrazów dla średnich i dużych laboratoriów.

Parametr Szczegóły

Procesor CPU 3,6 GHz (2 procesory)

Liczba rdzeni 8 na procesor / łącznie 16

Pamięć RAM 12 x 8 GB (96 GB)

Funkcja hyper-threading Wyłączona

Dysk twardy Dysk SSD o poj. 240 GB (2x)

System operacyjny Microsoft Windows Server 2016

Obsługa maszyny wirtualnej (VM) Tak

Dodatkowe informacje o maszynie wirtualnej Wydajność będzie inna niż w przypadku serwerów ﬁzycznych z powodu narzutu

związanego z maszyną wirtualną.

Program antywirusowy Symantec Endpoint Protection, wersja 12

Zasilanie 110 V/220 V, 800 watów (2)

Porty 2 USB, adapter HPE Eth 10/25 Gb

Zasilanie bezprzerwowe Zalecane

Złośliwe oprogramowanie lub nieuprawniony dostęp do aparatu

może doprowadzić do utraty danych lub niedostępności aparatu.

Aby uniknąć zarażenia systemu złośliwym oprogramowaniem

lub uniknąć nieuprawnionego dostępu i niewłaściwego

wykorzystania aparatu, kluczowe jest przestrzeganie

następujących zaleceń:

• Nie instalować ani nie uruchamiać żadnego innego

oprogramowania w aparacie.

• Upewnić się, że inne komputery i usługi w sieci są odpowiednio

zabezpieczone i chronione przed złośliwym oprogramowaniem

i nieuprawnionym dostępem. Dotyczy to na przykład

laboratoryjnego systemu informacyjnego (LIS), udostępniania

plików archiwizacji i kopii zapasowej lub usług.

• Klienci są odpowiedzialni za bezpieczeństwo ich sieci

lokalnej, zwłaszcza w sensie jej ochrony przed złośliwym

oprogramowaniem oraz atakami. Ochrona ta może obejmować

podjęcie środków, takich jak zainstalowanie zapory sieciowej,

w celu oddzielenia urządzenia od niekontrolowanych sieci.

Ochrona ta może również obejmować podjęcie środków

umożliwiających upewnienie się, że podłączona sieć jest wolna

od złośliwych kodów.

• Ograniczać dostęp ﬁzyczny do aparatu i całej podłączonej

infrastruktury informatycznej (komputery, kable, wyposażenie

sieciowe itd.).

• Upewnić się, że kopie zapasowe aparatu oraz pliki archiwizacji

są chronione przed nieuprawnionym dostępem i zabezpieczone

na wypadek katastrofy. Obejmuje to zdalne przechowywanie

danych, miejsca odzysku na wypadek katastrofy i bezpieczny

transfer plików kopii zapasowej.

• W razie potrzeby należy zastosować zaporę sieciową, aby

ograniczyć ruch sieciowy.

• Dysków USB można używać do wielu rodzajów tworzenia i

przywracania kopii zapasowych. Korzystanie z dysku USB

wnieprawidłowy sposób może spowodować utratę danych i

usterkę aparatu.

• Należy używać wyłącznie takich dysków USB, które zostały

przetestowane i zainstalowane przez przedstawiciela serwisu

ﬁrmy Roche.

• Można używać tylko jednego dysku USB naraz. Przed

włożeniem dysku USB należy upewnić się, że do urządzenia nie

włożono już innego dysku USB.

Bezpieczeństwo danych

• Przed wyjęciem dysku USB należy nacisnąć przycisk Wysuń

wsystemie Windows.

• Nie należy zmieniać domyślnej konﬁguracji systemu

operacyjnego (OS) dostarczonej z serwerem, ponieważ ma

to wpływ na utwardzone („hardening”) konﬁguracje systemu

operacyjnego (OS).

• Aby uniknąć zarażenia oprogramowania uPath enterprise

software przez wirusa, dysku USB należy używać wyłącznie

w aparacie. Na dysku USB nie należy przechowywać żadnych

innych danych.

8 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Przebieg pracy na potrzeby korzystania z algorytmu uPath HER2 (4B5)

Dostarczane materiały

• Algorytm uPath HER2 (4B5)

Materiały wymagane, ale niedostarczane

• Oprogramowanie uPath enterprise software

• Preparaty tkanki gruczołu sutkowego wybarwione przeciwciałem VENTANA anti-HER2/neu (4B5) (przy użyciu zestawu ultraView

Universal DAB Detection Kit), barwione w aparacie BenchMark ULTRA.

• Skaner preparatów VENTANA DP 200

Ostrzeżenia iśrodki ostrożności

1. Do stosowania w diagnostyce in vitro (IVD).

2. Wyłącznie dozastosowania profesjonalnego.

3. PRZESTROGA: W Stanach Zjednoczonych prawo federalne zezwala na sprzedaż tego wyrobu wyłącznie lekarzowi lub na zlecenie

lekarza. (Rx Only)

4. Aby zgłosić podejrzenie wystąpienia poważnych incydentów związanych z tym wyrobem, należy skontaktować się z lokalnym

przedstawicielem ﬁrmy Roche oraz właściwym organem w państwie członkowskim lub kraju, w którym użytkownik ma siedzibę.

Przebieg pracy

1. Tkanka gruczołu sutkowego znajdująca się na szkiełku podstawowym jest barwiona za pomocą przeciwciała VENTANA anti-HER2/

neu (4B5) przy użyciu aparatu BenchMark ULTRA.

2. Rejestracja obrazu (skanowanie całego preparatu) jest wykonywana za pomocą skanera preparatów VENTANA DP 200 przy

powiększeniu 20x w jednej płaszczyźnie Z.

3. Po rejestracji obrazów cyfrowych obrazy te są przesyłane z komputera skojarzonego ze skanerem preparatów VENTANA DP 200 do

systemu zarządzania obrazami (image management system, IMS) na scentralizowanym serwerze.

4. Po przesłaniu obrazów na serwer w oprogramowaniu uPath enterprise software zostanie utworzony przypadek. Przypadek może

zostać utworzony automatycznie poprzez komunikację z laboratoryjnym systemem informacyjnym (LIS) przy użyciu informacji

identyﬁkacyjnych (tj. typ tkanki i przeciwciało pierwszorzędowe) zawartych na etykiecie z kodem kreskowym preparatu lub

wprowadzonych ręcznie do oprogramowania uPath enterprise software. Więcej informacji można znaleźć w dokumencie

Oprogramowanie uPath enterprise software — podręcznik użytkownika (PN 1018943EN).

5. Jeśli zainstalowany jest algorytm uPath HER2 (4B5) (musi być zainstalowany na innym serwerze niż oprogramowanie uPath

enterprise software i system IMS), a do obrazu zarejestrowanego przy powiększeniu 20x dołączone są informacje o odpowiednim

barwniku i typie tkanki, wówczas oprogramowanie uPath enterprise software automatycznie uruchamia analizę całego preparatu

(whole slide analysis, WSA).

6. W ramach analizy WSA automatycznie analizowany jest cały zeskanowany obraz.

7. Patomorfolog jest powiadamiany przez oprogramowanie uPath enterprise software o ukończeniu analizy WSA poprzez wyświetlenie

niebieskiego paska z komunikatem „analysis successful” (analiza zakończona powodzeniem).

8. Patomorfolog może wybrać określone obszary ROI przeznaczone do oceny za pomocą narzędzi ROI i Exclusion (Wykluczanie)

dostępnych w oprogramowaniu uPath enterprise software.

9. Patomorfolog przegląda wyniki analizy obrazów i akceptuje wynik lub ręcznie zastępuje wynik innym wynikiem.

9 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Barwienie

• Przygotowanie i barwienie tkanek powinno odbywać się zgodnie z zaleceniami podanymi w arkuszu metody dla przeciwciała

VENTANA anti-HER2/neu (4B5).

• Wszystkie odpowiednie kontrole powinny zostać obejrzane, a preparaty powinny zostać ponownie wybarwione, jeśli barwienie nie

spełnia wytycznych określonych w arkuszu metody dla przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5).

• Algorytm uPath HER2 (4B5) wymaga użycia przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5) oraz dowolnego dodatkowego materiału lub

zasobów wymienionych w arkuszu metody dla przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5) do wybarwienia tkanek przed analizą.

• Przeciwciało VENTANA anti-HER2/neu (4B5) wykrywa białko HER2 w skrawkach FFPE tkanki gruczołu sutkowego wybarwionych za

pomocą zestawu ultraView Universal DAB Detection Kit w aparacie BenchMark ULTRA.

Rejestracja obrazu

Do skanowania preparatów wymagany jest skaner preparatów VENTANA DP 200. Obrazy należy skanować przy powiększeniu 20x.

Zalecane jest, aby tkanka nie była pofałdowana ani nie znajdowały się na niej plamy atramentu. Jeśli duże obszary obrazu są nieostre,

zalecane jest ponowne przeskanowanie preparatów. Dalsze informacje dotyczące skanowania zawiera dokument Skaner preparatów

VENTANA DP 200 IVD — podręcznik użytkownika (PN 1017149PL).

Ogólne informacje dotyczące poruszania się po oprogramowaniu uPath enterprise software

Możliwe jest dostosowanie oprogramowania uPath enterprise software do potrzeb indywidualnych oraz potrzeb ośrodka; istnieje

m.in. możliwość konﬁguracji raportów i dostosowania interfejsu użytkownika. W tym podręczniku do algorytmu skupiono się

wyłącznie na narzędziach niezbędnych do korzystania z algorytmu uPath HER2 (4B5). Więcej informacji na temat oprogramowania

uPath enterprise software można znaleźć w dokumencie Oprogramowanie uPath enterprise software — podręcznik użytkownika.

10 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Przebieg pracy wykonywanej przez patomorfologa

Otwieranie przypadku w oprogramowaniu uPath enterprise software

W celu uzyskania dostępu do obrazów tkanki gruczołu sutkowego wybarwionej za pomocą przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu

(4B5) należy dwukrotnie kliknąć przypadek lub wybrać przypadek i nacisnąć zakładkę Viewer (Przeglądarka) (Rysunek 1).

Zostanie wyświetlony ekran przedstawiający wszystkie obrazy powiązane z przypadkiem (Rysunek 2).

Rysunek 2

Rysunek 1

11 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Po zeskanowaniu szkiełka podstawowego, wybarwionego za pomocą przeciwciała VENTANA anti-HER2/neu (4B5) w skanerze

preparatów VENTANA DP 200 przy powiększeniu 20x, obraz jest importowany do oprogramowania uPath enterprise software i

kojarzony z przypadkiem. Algorytm uPath HER2 (4B5) automatycznie uruchomi analizę WSA. Czas trwania kroku wykonywania

wstępnych obliczeń w ramach analizy WSA zależy od specyﬁkacji serwera, rozmiarów obrazów i liczby obrazów w kolejce. Komunikat

„waiting to start auto-analysis” (oczekiwanie na rozpoczęcie automatycznej analizy) wskazuje, że obrazy znajdują się w kolejce, ale

jeszcze nie są analizowane, a komunikat „analyzing” (analizowanie) wskazuje, że wykonywana jest analiza WSA (Rysunek 3 i 4).

Po ukończeniu analizy obrazu w ramach analizy WSA w oprogramowaniu uPath enterprise software pod obrazem preparatu wobszarze

Viewer (Przeglądarka) zostanie wyświetlony komunikat „analysis successful” (analiza zakończona powodzeniem) (Rysunek 5). Przed

pomyślnym ukończeniem analizy WSA nie można wygenerować wyników dla obrazów.

Rysunek 5

Rysunek 4

Rysunek 3

12 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Rysowanie obszarów ROI obejmujących całą zmianę nowotworową: zaznaczanie obszaru zmiany nowotworowej

Aby wybrać obszar zmiany nowotworowej do analizy na obrazie preparatu IHC, należy użyć przycisku narzędzia Freehand

(Odręcznie), który znajduje się menu rozwijanym obszaru ROI (Rysunek 6). Na rysunku 7 przedstawiono obraz, na którym narysowano

jeden obszar ROI. Można narysować dodatkowe obszary ROI. Po zaznaczeniu każdego żądanego obszaru obszar ROI zostanie

wyświetlony na panelu Slide Panel (Panel preparatów) (Rysunek 8).

Rysunek 7

Rysunek 8

Rysunek 6

13 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Rysowanie obszarów ROI obejmujących całą zmianę nowotworową: wykluczony obszar

Podczas rysowania obszarów ROI może być wymagane wykluczenie niektórych obszarów; obszary, których należy unikać lub które

należy pominąć podczas rysowania obszarów ROI, zostaną omówione, wraz z przykładami, w znajdującej się dalej części dotyczącej

charakterystyki barwienia. Aby wykluczyć określone obszary (Rysunek 10), należy użyć narzędzia wykluczenia Freehand (Odręcznie),

które znajduje się menu rozwijanym Exclusion (Wykluczanie) (Rysunek 9). Jeśli duże obszary obrazu są rozmyte lub nieostre, należy

ponownie przeskanować preparat.

Wykluczone obszary nie będą analizowane przez algorytm uPath HER2 (4B5), a wybarwione i niewybarwione komórki nowotworowe

w tym obszarze zostaną wykluczone z całkowitego obszaru poddawanego analizie. Jeśli wykluczenie zastosowano w obszarze ROI,

który został już przeanalizowany, należy ponownie wykonać analizę obszaru ROI, aby odpowiednio zaktualizować nakładkę i wynik.

Narysowanie dużej liczby obszarów do wykluczenia — zwłaszcza jeśli są to skomplikowane obszary obrysowywane przy użyciu

narzędzia Freehand (Odręcznie) — może zająć dużo czasu i obniżyć wydajność przebiegu pracy, a tylko w minimalnym stopniu wpłynąć

na końcowy wynik. Jeśli wymagane jest narysowanie dużej liczby obszarów do wykluczenia dla przypadku, patomorfolog powinien:

• Narysować wiele obszarów ROI i wykluczyć fragmenty tkanki, które w mniemaniu patomorfologa nie nadają się do oceny,

maksymalnie ograniczając korzystanie z narzędzia Exclusion (Wykluczanie).

• Ograniczyć liczbę obszarów do wykluczenia i ręcznie zastąpić wynik innym wynikiem.

Rysowanie obszarów ROI obejmujących całą zmianę nowotworową: usuwanie

Jeśli wybrany obszar ROI całej zmiany nowotworowej nie jest optymalny, można go usunąć. Wybrać obszar ROI całej zmiany nowotworowej,

klikając środek obszaru ROI na obrazie, a następnie klikając przycisk Delete (Usuń) na panelu Slide Panel (Panel preparatów) (Rysunek 11)

lub na obrazie preparatu w pobliżu obszaru ROI (Rysunek 12). Zostanie wyświetlone okno z monitem o potwierdzenie. Wybrać opcję

Conﬁrm (Potwierdź), aby usunąć wybrany obszar ROI. Wybrać opcję Cancel (Anuluj), aby zachować obszar ROI.

Rysunek 9

Rysunek 11

Rysunek 12

Rysunek 10

14 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Po narysowaniu wszystkich obszarów ROI całej zmiany nowotworowej i/lub obszarów wykluczenia obraz jest gotowy do analizy.

Wybrać obszar ROI całej zmiany nowotworowej, klikając środek obszaru ROI, który ma zostać przeanalizowany, lub klikając obszar

ROI na panelu Slide Panel (Panel preparatów). Dla każdego obszaru ROI kliknąć przycisk Image Analysis (Analiza obrazu) na panelu

Slide Panel (Panel preparatów) (Rysunek 13) lub obok obszaru ROI (Rysunek 14).

Po ukończeniu analizy HER2 wynik zostanie wyświetlony w dwóch miejscach na panelu Slide Panel (Panel preparatów): pod

obszarem Slide Score (Wynik preparatu) oraz obok obszarów ROI (Rysunek 15). Wartość Slide Score (Wynik preparatu) jest oparta na

podsumowaniu statusów HER 2 uzyskanych we wszystkich wybranych obszarach ROI; wynik ten pojawi się w raporcie.

Można także wyświetlić bardziej szczegółowe informacje na liście rozwijanej Slide Score (Wynik preparatu) oraz liście rozwijanej ROI

Details (Szczegóły obszaru ROI), klikając ikonę listy rozwijanej (Rysunek 16). Zostanie wyświetlona lista rozwijana Slide Score (Wynik

preparatu) (Rysunek 17). Ponowne kliknięcie tej samej ikony listy rozwijanej spowoduje zwinięcie tych informacji.

Rysunek 15

Rysunek 17

Rysunek 16

Rysunek 13

Rysunek 14

15 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Analiza obrazu pod kątem białka HER2: kolorowa nakładka

Na obszarze ROI zostanie wyświetlona kolorowa nakładka po naciśnięciu przycisku ROI(s) Analysis (Analiza obszarów ROI) i

przeanalizowaniu tkanki. Czerwona nakładka na poniższym obrazie (Rysunek 18) przedstawia błony komórkowe określone jako

wybarwione pozytywnie względem HER2. Podczas chwytania obrazu (naciśnięcie lewego przycisku myszy i przesunięcie obrazu)

nakładka zniknie (Rysunek 19). Po zwolnieniu przycisku myszy nakładka pojawi się ponownie (Rysunek 18).

Rysunek 18

Rysunek 19

16 Algorytm uPath HER2 (4B5) do analizy obrazów tkanki gruczołu sutkowego — Podręcznik

Strona się ładuje...

Roche uPath IVD Instrukcja obsługi

Marka: Roche

Model: uPath IVD

Typ: Instrukcja obsługi

Pobierz PDF

raport

Roche uPath IVD Instrukcja obsługi

Roche uPath IVD Instrukcja obsługi

Powiązane artykuły

Inne dokumenty